plateforme BIOMET


La plateforme BIOMET de métabolomique est labellisée plateforme technologique AMU depuis 2016, et rattachée au C2VN. Elle est partenaire de l’initiative nationale de métabolomique « METABOHUB » et est membre du RFMF depuis 2010.
La métabolomique est une science qui étudie l'ensemble des métabolites primaires (sucres, acides aminés, acides gras, etc.) et des métabolites secondaires dans le cas des plantes (polyphénols, flavonoïdes, alcaloïdes, etc.) présents dans une cellule, un organe, un organisme.
Depuis 2005, BIOMET développe une expertise en métabolomique et lipidomique par spectrométrie de masse à haute résolution, dans le domaine de :
- Nutrition
- Santé humaine
- Environnement et agronomie
BIOMET a piloté le plus grand test inter-plateformes de validation de la métabolomique non ciblée, l’initiative METABORING
(libre accès, doi: 10.1007/s11306-014-0740-0).
BIOMET est classée dans le top 18% des structures publiant le plus dans le domaine de la métabolomique (source Scholar).
BIOMET a développé une méthodologie permettant l’analyse de plus de 830 métabolites et 400-750 types de lipides, avec un savoir-faire pour l’analyse statistique et l’interprétation biologique.
BIOMET est également experte dans l’analyse multi-échelle, capable d’assembler des jeux de données d’origines différentes (cliniques, génomiques, phénotypiques, imagerie, métabolomiques).
L’activité académique de BIOMET est complétée par l’activité « affaire » portée par CRIBIOM
dédiée aux prestations de service vers ses partenaires privés, notamment la métabolomique.
CRIBIOM est également plateforme attachée à l’Institut Carnot STAR
BIOMET est équipée d’un 1 GCMS Agilent basse résolution, 1 LCMS QTOF microTOFQBruker, 1 LCMS QExactive+ Thermo, et dispose d’un GC FID pour le profilage ultra-rapide d’acides gras.
Instruments

Spectromètre
Spectromètre de masse haute résolution couplé à la chromatographie liquide

Spectromètre
Spectromètre de masse couplé à la chromatographie gazeuse
MS Nutrition est partenaire de BIOMET/CRIBIOM pour les analyses statistiques avancées.
Publications princeps
Martin, J.-C., Maillot, M., Mazerolles, G., Verdu, A., Lyan, B., Migne, C., Defoort, C., Canlet, C., Junot, C., Guillou, C., et al.(2015). Can we trust untargeted metabolomics? Results of the metabo-ring initiative, a large-scale, multi-instrument inter-laboratory study. Metabolomics11(4), 807-821.
Martin, J. C., Berton, A., Ginies, C., Bott, R., Scheercousse, P., Saddi, A., Gripois, D., Landrier, J. F., Dalemans, D., Alessi, M. C., et al.(2015). Multi-level systems biology modeling characterized the atheroprotective efficiencies of modified dairy fats in a hamster model. Am J PhysiolHeartCircPhysiol309, H935-H945.
Aidoud, N., Delplanque, B., Baudry, C., Garcia, C., Moyon, A., Balasse, L., Guillet, B., Antona, C., Darmaun, D., Fraser, K., et al.(2018). A combination of lipidomics, MS imaging, and PET scan imaging reveals differences in cerebral activity in rat pups according to the lipid quality of infant formulas. FASEB J32(9), 4776-4790.
Contact

Responsable scientifique
Jean-Charles Martin
RESEARCHGATE
jean-charles.martin@univ-amu.fr
Tél : 04 91 32 46 63