plateforme PhenoMARS

L’objectif de PhenoMARS est de mettre en évidence des modifications du métabolisme énergétique chez le rongeur (rat, souris sauvages ou transgéniques) en réponse à diverses approches nutritionnelles (déficiences ou supplémentation en nutriments, extraits, aliments, modifications du régime alimentaire, etc.), différentes situations physiologiques (activité physique, vieillissement, etc.) et pathologiques (obésité, diabète de type 2, stéatose hépatique, etc.), et d’en décrypter les mécanismes moléculaires, tissulaires et cellulaires sous-jacents.

Nous disposons d’un équipement permettant de caractériser chez le rongeur la dépense énergétique par calorimétrie indirecte. Cette approche globale peut être complétée par une quantification de l’activité physique et la prise alimentaire, ainsi de très nombreux paramètres morphologiques et biologiques en lien avec l’homéostasie glucidique (tests de tolérance au glucose et à l’insuline) et lipidique (test de charge lipidique). Ces méthodologies descriptives visant à caractériser le métabolisme énergétique de l’animal sont complétées par une expertise forte en phénotypage moléculaire, permettant d’analyser les voies de signalisation, l’expression de gènes clé et de microARN impliqués dans la régulation des grandes fonctions (métabolisme lipidique, glucidique, inflammation, beigisation du tissu adipeux, etc.) en lien avec le métabolisme énergétique, ainsi que l’histologie des tissus métaboliquement actifs (tissu adipeux et foie). En complément de ces travaux précliniques, des validations cliniques pourront être mises en place en collaboration avec des services hospitaliers.

PhenoMARS peut également réaliser des analyses sur des échantillons générés (lors d’études précliniques ou cliniques) par d'autres structures ou établir des partenariats avec d'autres plateformes technologiques pour compléter l'offre d'analyses proposées (imagerie, métabolomique, cytométrie).

La plateforme accompagne le partenaire dans la définition de son projet, l’aide dans la conception du plan expérimental, la rédaction des dossiers éthiques, prend en charge les différentes étapes des protocoles et participe à l’interprétation des résultats des protocoles précliniques et cliniques.

Le comité scientifique et technique de la plateforme est constitué des Dr Jean-François Landrier (DR INRAE), Dr Lourdes Mounien (MCU-HDR, AMU), et Dr Flavie Sicard (IR, Protisvalor).

Instruments

Cage Calorimétrique Bioseb

Le système de Physiocage Bioseb permet chez le rongeur

1) la mesure complète du métabolisme respiratoire qui est un reflet du métabolisme énergétique,

2) le suivi de la prise de nourriture et de boisson,

3) d'évaluer le comportement (redressement et activité spontanée)

Roues d'activité Phymep

Ces roues d'activité permettent la mesure précise de l'activité motrice du rongeur sur une période de temps choisie.

Agilent AriaDX PCR

Le système AriaDx Real-Time PCR permet de mesurer en temps réel l'expression génique. Cet appareillage est une solution qPCR entièrement intégrée pour l'amplification, la détection et l'analyse des données.

Lecteur de plaque VictorX4 Perkin Elmer

Le lecteur VICTOR X4 permet la lecture de plaques colorimétriques utilisées lors des tests de type ELISA par exemple. Cet outil propose plusieurs méthodes de détection : la luminescence, l'intensité de la fluorescence, l'absorbance UV, FRET.

Analyseur hématologique Leytemed

Cet outil permet d'obtenir la formule sanguine (taux de plaquettes, leucocytes)

Fonctionnement

La partie administrative du fonctionnement et les relations clients sont prises en charge par la plateforme. La gestion financière des contrats est assurée par ProtisValor Méditerranée (filiale d’Aix Marseille Université). Les services de la plateforme PhenoMARS sont également accessibles par le biais de la structure CriBiom, de même que les services de la plateforme Biomet (mettre le lien pour accéder à la page Biomet).

Ci-dessous, les publications princeps qui illustrent les compétences des responsables de PhenoMARS

1- Botanic Origin of Propolis Extract Powder Drives Contrasted Impact on Diabesity in High-Fat-Fed Mice - PubMed (nih.gov)

2-Combined Beneficial Effect of Voluntary Physical Exercise and Vitamin D Supplementation in Diet-induced Obese C57BL/6J Mice - PubMed (nih.gov)

3-Prenatal maternal vitamin D deficiency sex-dependently programs adipose tissue metabolism and energy homeostasis in offspring - PubMed (nih.gov)

4-Poplar Propolis Ethanolic Extract Reduces Body Weight Gain and Glucose Metabolism Disruption in High-Fat Diet-Fed Mice - PubMed (nih.gov)

5-Vitamin D Supplementation Improves Adipose Tissue Inflammation and Reduces Hepatic Steatosis in Obese C57BL/6J Mice - PubMed (nih.gov)

6-(all-E)- and (5Z)-Lycopene Display Similar Biological Effects on Adipocytes - PubMed (nih.gov)

7-Diet induced obesity modifies vitamin D metabolism and adipose tissue storage in mice - PubMed (nih.gov)

8-Lycopene and tomato powder supplementation similarly inhibit high-fat diet induced obesity, inflammatory response, and associated metabolic disorders - PubMed (nih.gov)

9-Vitamin D limits inflammation-linked microRNA expression in adipocytes in vitro and in vivo: A new mechanism for the regulation of inflammation by vitamin D - PubMed (nih.gov)

10-Obesity-associated Inflammation Induces microRNA-155 Expression in Adipocytes and Adipose Tissue: Outcome on Adipocyte Function - PubMed (nih.gov)

11-Glut2-dependent glucose-sensing controls thermoregulation by enhancing the leptin sensitivity of NPY and POMC neurons - PubMed (nih.gov)

12-MicroRNAs are involved in the hypothalamic leptin sensitivity - PubMed (nih.gov)

La plateforme PhenoMARS bénéficie du soutien de l’université d’Aix-Marseille (labélisation en 2020), du pôle de compétitivité Innov’Alliance ainsi que de l’IC STAR.

Il existe des collaborations avec d’autres plateformes labélisées Aix-Marseille (BIOMET, CRMBM, Technosport, TGML) et d’autres se développent (AMUTYCIT, CERIMED).

Des partenariats scientifiques existent également avec Biomeostasis qui est un industriel spécialisé dans l’étude du métabolisme énergétique.